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传染病问题中的SIR模型
摘要:
2003年春来历不明的SARS病毒突袭人间,给人们的生命财产带来极大的危害。长期以来,建立传染病的数学模型来描述传染病的传播过程,分析受感染人数的变化规律,探索制止传染病蔓延的手段等,一直是我国及全世界有关专家和官员关注的课题。
不同类型的传染病的传播过程有其各自不同的特点,我们不是从医学的角度一一分析各种传染病的传播,而是从一般的传播机理分析建立各种模型,如简单模型,SI模型,SIS模型,SIR模型等。在这里我采用SIR(Susceptibles,Infectives,Recovered)模型来研究如天花,流感,肝炎,麻疹等治愈后均有很强的免疫力的传染病,它主要沿用由Kermack与McKendrick在1927年采用动力学方法建立的模型。应用传染病动力学模型来描述疾病发展变化的过程和传播规律,预测疾病发生的状态,评估各种控制措施的效果,为预防控制疾病提供最优决策依据, 维护人类健康与社会经济发展。 关键字:传染病;动力学;SIR模型。 一﹑模型假设
1. 在疾病传播期内所考察的地区范围不考虑人口的出生、死亡、流动等种群动力因素。总人口数N(t)不变,人口始终保持一个常数N。人群分为以下三类:易感染者(Susceptibles),其数量比例记为s(t),表示t时刻未染病但有可能被该类疾病传染的人数占总人数的比例;感染病者(Infectives),其数量比例记为i(t),表示t时刻已被感染成为病人而且具有传染力的人数占总人数的比例;恢复者(Recovered),其数量比例记为r(t),表示t时刻已从染病者中移出的人数(这部分人既非已感染者,也非感染病者,不具有传染性,也不会再次被感染,他们已退出该传染系统。)占总人数的比例。 2. 病人的日接触率(每个病人每天有效接触的平均人数)为常数λ,日治愈率(每天被治愈的病人占总病人数的比例)为常数μ,显然平均传染期为1/μ,传染期接触数为σ=λ/μ。该模型的缺陷是结果常与实际有一定程度差距,这是因为模型中假设有效接触率传染力是不变的。 二﹑模型构成
在以上三个基本假设条件下,易感染者从患病到移出的过程框图表示如下:
s λsi i μi r 在假设1中显然有:
s(t) + i(t) + r(t) = 1 (1)
对于病愈免疫的移出者的数量应为
Ndr??Ni (2) dt 1
2
不妨设初始时刻的易感染者,染病者,恢复者的比例分别为s0(s0>0),i0(i0>0),
r0=0.
SIR基础模型用微分方程组表示如下:
?di?dt??si??i??ds????si (3) ?dt?dr?dt??i?s(t) , i(t)的求解极度困难,在此我们先做数值计算来预估计s(t) , i(t)的一般变化规律。
三﹑数值计算
在方程(3)中设λ=1,μ=0.3,i(0)= 0.02,s(0)=0.98,用MATLAB软件编程: function y=ill(t,x) a=1;b=0.3;
y=[a*x(1)*x(2)-b*x(1);-a*x(1)*x(2)]; ts=0:50;
x0=[0.02,0.98];
[t,x]=ode45('ill',ts,x0); plot(t,x(:,1),t,x(:,2)) pause
plot(x(:,2),x(:,1))
输出的简明计算结果列入表1。i(t) , s(t)的图形以下两个图形,i~s图形称为相轨线,初值i(0)=0.02,s(0)=0.98相当于图2中的P0点,随着t的增,(s,i)沿轨线自右向左运动.由表1、图1、图2可以看出,i(t)由初值增长至约t=7时达到最大值,然后减少,t→∞,i→0,s(t)则单调减少,t→∞,s→0.0398. 并分析i(t),s(t)的一般变化规律.
t i(t) s(t) t i(t) s(t)
0 1 2 3 4 5 6 7 8 0.0200 0.0390 0.0732 0.1285 0.2033 0.2795 0.3312 0.3444 0.3247 0.9800 0.9525 0.9019 0.8169 0.6927 0.5438 0.3995 0.2839 0.2027 9 10 15 20 25 30 35 40 45 0 0.2863 0.2418 0.0787 0.0223 0.0061 0.0017 0.0005 0.0001 0.1493 0.1145 0.0543 0.0434 0.0408 0.0401 0.0399 0.0399 0.0398 2
3
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表1 i(t),s(t)的数值计算结果
四﹑相轨线分析
我们在数值计算和图形观察的基础上,利用相轨线讨论解i(t),s(t)的性质。 i ~ s平面称为相平面,相轨线在相平面上的定义域(s,i)∈D为
D = {(s,i)| s≥0,i≥0 , s + i ≤1} (4) 在方程(3)中消去dt并注意到σ的定义,可得
di?1????1?, i|s?s0?i0 (5) ds?sσ?
?1??1?ds ? 所以: di???sσ??1?d??1?ds (6) ?i0i?s0?sσ??is利用积分特性容易求出方程(5)的解为: i?(s0?i0)?s?1?lns (7) s0在定义域D内,(6)式表示的曲线即为相轨线,如图3所示.其中箭头表示了随着时间t的增加s(t)和i(t)的变化趋向.
1
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iD
P2imP1i?os?1/?s
下面根据(3),(17)式和图9分析s(t),i(t)和r(t)的变化情况(t→∞时它们的极限值分别记作
s?, i?和r?)。
1.不论初始条件s0,i0如何,病人消失将消失,即: i0?0 (8) 其证明如下:
首先,由(3)
dsdr?0 而 s(t)?0 故s? 存在; 由(2) ?0而 r(t)?1 故r? 存 dtdt在;再由(1)知i?存在。
dr??? , 这将导致r???,与r?存在相dt2其次,若i????0则由(1),对于充分大的t 有
矛盾.从图形上看,不论相轨线从P1或从P2点出发,它终将与s轴相交(t充分大).
2.最终未被感染的健康者的比例是s?,在(7)式中令i=0得到, s?是方程
1s??0 (9) s0 s0?i0?s???ln在(0,1/σ)内的根.在图形上s?是相轨线与s轴在(0,1/σ)内交点的横坐标.
di?1d?1?????1??o,i(t)先增加, 令i???1?=0,可得当s=1/ds?sσ?ds?sσ? 3.若s0>1/σ,则开始有
2
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σ时,i(t)达到最大值:
1 im?s0?i0?(1?ln?s0) (10)
?然后s<1/σ时,有
di?1????1??o ,所以i(t)减小且趋于零,s(t)则单调减小至s?,如图3中ds?sσ?由P1(s0,i0)出发的轨线.
di?1????1??0,i(t)单调减小至零,s(t)单调减小至s?,如图3中ds?sσ?4.若s0 ?1/σ,则恒有由P2(s0,i0)出发的轨线.
可以看出,如果仅当病人比例i(t)有一段增长的时期才认为传染病在蔓延,那么1/σ是一个阈值,当s0>1/σ(即σ>1/s0)时传染病就会蔓延.而减小传染期接触数σ,即提高阈值1/σ使得s0≤1/σ(即σ ≤1/s0),传染病就不会蔓延(健康者比例的初始值s0是一定的,通常可认为
s0接近1)。
并且,即使s0>1/σ,从(19),(20)式可以看出, σ减小时, s?增加(通过作图分析), im降低,也控制了蔓延的程度.我们注意到在σ=λμ中,人们的卫生水平越高,日接触率λ越小;医疗水平越高,日治愈率μ越大,于是σ越小,所以提高卫生水平和医疗水平有助于控制传染病的蔓延.
从另一方面看, ?s??s?1/?是传染期内一个病人传染的健康者的平均数,称为交换数,其含义是一病人被?s个健康者交换.所以当 s0?1/? 即?s0?1时必有 .既然交换数不超过1,病人比例i(t)绝不会增加,传染病不会蔓延。
五﹑群体免疫和预防
根据对SIR模型的分析,当s0?1/? 时传染病不会蔓延.所以为制止蔓延,除了提高卫生和医疗水平,使阈值1/σ变大以外,另一个途径是降低s0 ,这可以通过比如预防接种使群体免疫的办法做到.
忽略病人比例的初始值i0有s0?1?r0,于是传染病不会蔓延的条件s0?1/? 可以表为
3
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r0?1?1? (11)
这就是说,只要通过群体免疫使初始时刻的移出者比例(即免疫比例)满足(11)式,就可以制止传染病的蔓延。
这种办法生效的前提条件是免疫者要均匀分布在全体人口中,实际上这是很难做到的。据估计当时印度等国天花传染病的接触数 σ=5,由(11)式至少要有80%的人接受免疫才行。据世界卫生组织报告,即使花费大量资金提高r0,也因很难做到免疫者的均匀分布,使得天花直到1977年才在全世界根除。而有些传染病的σ更高,根除就更加困难。 六﹑模型验证
上世纪初在印度孟买发生的一次瘟疫中几乎所有病人都死亡了。死亡相当于移出传染系统,有关部门记录了每天移出者的人数,即有了据对SIR模型作了验证。
首先,由方程(2),(3)可以得到
dsd???si????si???sr dtdtdr的实际数据,Kermack等人用这组数dt 上式两边同时乘以dt可?s1ds???dr ,两边积分得 srs1s?e??r ?ds????dr?lns|s0???r?s0sr0?0s0所以: s(t)?s0e??r(t) (12)
dr??i??(1?r?s)??(1?r?s0e??r) (13) dt再?当 r?1/? 时,取(13)式右端e??rTaylor展开式的前3项得:
s0?2r2dr??(1?r?s0??s0r?) dt2在初始值r0=0 下解高阶常微分方程得:
1???t?(s??1)??th(??) (14) 0?s0?2?2??4
r(t)?
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其中?2?(s0??1)2?2s0i0?2,th??s0??1? 从而容易由(14)式得出:
dr?2?? (15) dt2s?2ch2(??t??)02 然后取定参数 s0, σ等,画出(15)式的图形,如图4中的曲线,实际数据在图中用圆点表示,可以看出,理论曲线与实际数据吻合得相当不错。
七﹑被传染比例的估计
在一次传染病的传播过程中,被传染人数的比例是健康者人数比例的初始值s0与s?之差,记作x,即 x?s0?s? (16)
当i0很小,s0接近于1时,由(9)式可得 x?1ln(1?x)?0 (17) s0?取对数函数Taylor展开的前两项有 x(1?1s0??x2s02?)?0 (18)
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记 s0?1??? , ? 可视为该地区人口比例超过阈值
11的部分。当 ??
??时(18)式给出
1??x?2s0??s0???2? (19)
???这个结果表明,被传染人数比例约为?的2倍。对一种传染病,当该地区的卫生和医
1疗水平不变,即?不变时,这个比例就不会改变。而当阈值提高时,?减小,于是这个
?比例就会降低。 八﹑评注
该模型采用了数值计算,图形观察与理论分析相结合的方法,先有感性认识(表1,图1,图2),再用相轨线作理论分析,最后进行数值验证和估算,可以看作计算机技术与建模方法的巧妙配合。可取之处在于它们比较全面地达到了建模的目的,即描述传播过程、分析感染人数的变化规律,预测传染病高潮到来时刻,度量传染病蔓延的程度并探索制止蔓延的手段和措施。
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