Kanamicin 使用10μg/ml 配置10mg/L DP 2,2’-二连吡啶 配置100Mm 酒精溶解 FeSO4 使用40μΜ,配置20mM 盐酸溶解
I
分泌型信号肽的筛选及其在鳗弧菌分泌表达中的应用 1
1.
菌种、质粒 、引物 大肠杆菌TOP10克隆宿主菌
AV-1鳗弧菌表达宿主 野生型鳗弧菌MVM425
载体质粒pUC18
来源 本实验室 本实验室 本实验室 Novagen
2.① LB液体培养基:按酵母粉5 g/l,胰蛋白胨 10 g/l,NaCl 5 g/l称取各组分,加入
去离子水后用10 mol/l NaOH调pH至7.0,并用去离子水定容。混匀后121℃高压蒸气灭菌25 min。
② LB氨苄固体培养基:按2g/100ml向LB液体培养基中加入琼脂粉,121℃高压灭菌
25 min。趁热摇匀,冷却至约60℃,加入Amp至终浓度100 g/ml,摇匀后倒入培养皿中。凝固后于37 ℃恒温箱中烘干,保存在4 ℃冰箱中。 ③ A-I-X平板配制:
每100ml的LB中加入 a 100l Amp(50mg/ml) b 100l IPTG(24mg/ml) c 200l X-Gal(20mg/ml) 3.用于琼脂糖凝胶电泳的试剂
① 0.7 %琼脂糖凝胶:称取0.28 g琼脂糖溶于40 ml 1TAE缓冲液中,在微波炉中加
热,待琼脂糖完全溶解后迅速倒入制胶台。冷却40分钟后可点样电泳。
② 10TAE缓冲液:将2.42 g Tris碱溶于400 ml双蒸水中,加入5.71 ml冰乙酸和 10ml
0.5 mmol/L的EDTA,定容至1000ml。使用前稀释10倍。 4. 用于SDS-PAGE电泳的试剂
① 5样品缓冲液:分别加入0.6 ml 1 mol/l Tris-HCl (pH6.8),5 ml 50%(v/v)甘油, 2 ml
10%SDS,0.5 ml 2-巯基乙醇(DDT),1 ml 1%溴酚蓝,补蒸馏水至10 ml。使用时与样品混合,稀释至1。
② 5电泳缓冲液:称取15.1 g Tris碱,72.0 g甘氨酸,5.0 g SDS,加去离子水定容至
1000 ml,使用前稀释至1。
③ 染色液:称取2.5 g考马斯亮蓝R-250,加入450 ml甲醇,100 ml乙酸,定容至1000
ml,用滤纸过滤后可使用。
④ 脱色液:量取100 ml乙醇,50 ml冰乙酸,稀释至500 ml。
5. ELISA及western实验中所需要的一些试剂的配制方法
ELISA洗液及HRP标记抗体稀释液pH 7.4,PBST的配制见表3.4。
分泌型信号肽的筛选及其在鳗弧菌分泌表达中的应用 2
表3.4 ELISA及western实验试剂配方
NaCl KH2PO4 Na2HPO4·12H2O
NaN3 KCl H2O Tween 20
4°C保存备用
2.0克 0.2克 2.9克 0.2克 0.2克 至1000ml 0.5ml
Western blot 抗体或免疫球蛋白稀释液0.01mol/L pH 7.2的PBS配方见表3.5。
表3.5 pH 7.2的PBS配方
NaH2PO4·2H2O Na2HPO4 NaCl NaN3 H2O(蒸馏水)
6.连接
0.39克 1.27克 0.85克 200mg 至 1000ml
目的基因与pMD19 T-simple Vector相连,连接体系见表3.12:
表3.12 T-载体连接体系
物质
pMD19 T-simple Vector 目的基因 Solution 总体积
连接反应在16℃下,反应8h。 b转化
用量 1l 4l 5l 10l
将连接液转化Top10大肠杆菌感受态细胞,涂LB(A-I-X)的LB琼脂平板,置37℃恒温箱,培养14-18h。 c菌落PCR
从LB(A-I-X)平板上挑取几个白色单菌落并做好对应标记,分别接入含800l低盐培养液的无菌EP管中, 250rpm培养3h左右。每个菌取200l在沸水中煮5min,12000rmp室温离心2min。上清作为PCR的模板DNA,PCR体系见表3.13 表3.13 Premix Taq (Takara)反应体系
分泌型信号肽的筛选及其在鳗弧菌分泌表达中的应用 3
物质
ExTag Master Mix 模板DNA(验证的菌) 引物M13 forward 引物M13 reverse ddH2O 总体积
反应条件
预热 95℃ 1 min
模板DNA变性 95℃ 30 sec
用量 6.5l 2 l 1.3 l 1.3 l 1.9 l 13 l
引物退火 55℃ 50 sec 35 cycles 链延伸 72℃ Bmin
72℃ 7min 4℃ Forever
d电泳鉴定
PCR产物进行0.7%琼脂糖凝胶电泳,阳性菌接种到5ml的低盐培养液中,加Amp至终浓度100ug/ml,200rpm,37℃过夜培养。 7. 抽取含有目的基因的质粒。
使用质粒抽提试剂盒(上海天根生化科技公司(Tiangen)),抽提得50 l质粒,于-20℃保存备用。
8. 重组质粒的构建、转化及鉴定 (1)载体质粒的制备 抽提载体质粒
使用Plasmid Mini Kit(上海天根生化科技公司(Tiangen),抽提得50 l质粒pUC18,于-20℃保存备用。
(2)载体质粒与目的基因的酶切消化及回收
①载体质粒与目的基因的双酶切(酶切反应体系见表3.14a,3.14b)
表3.14a 双酶切反应体系
DNA溶液 目的片段 15 l 10×T buffer 3 l SmaI 1 l XbaI 1 l 0.1%BSA 3l ddH20 7l 总V 30 l
分泌型信号肽的筛选及其在鳗弧菌分泌表达中的应用 4
体系均在37℃水浴保温下酶切3 h。 ②酶切片段的回收纯化
将上述酶切后的DNA样品在0.7 %琼脂糖凝胶上电泳,割下含目的片段的琼脂糖块,用Gel Extraction Mini Kit进行回收纯化,得到双酶切片段各30l。 (3)载体质粒和目的基因的连接
根据电泳结果确定载体与目的基因的用量比例。
使用DNA Ligation Kit(Takara)进行操作,连接体系见表3.15:
表3.15 连接体系
载体 2 l
置16℃恒温箱中反应8 h。 8.重组质粒的转化及鉴定 ①感受态细胞的制备
基因 3 l
Solution I 5l
总V
10l
克隆宿主TOP10 competent cell的制备
①蘸取TOP10甘油保存的菌液,接种于2 ml LB培养基,37℃,250 rpm振摇14-18h ②取1 ml已活化的菌液,接种于100 ml LB培养基中37℃,250 rpm恒温振摇至OD600=0.375
③将培养液分装到2个50 ml离心管中,冰浴5-10 min ④4℃,1600 g离心7 min,弃上清
⑤各管细胞沉淀用10 ml 冰冷CaCl2(0,06 mmol/L CaCl2,15 %甘油,0.01 mmol/L
PIPES,pH7.0,过滤灭菌)重悬,4℃,1100g离心5 min,弃上清
⑥各管细胞沉淀用10 ml 冰冷CaCl2重悬,冰浴30 min ⑦4℃,1100 g离心5 min,弃上清
⑧各管细胞沉淀用2 ml冰冷CaCl2重悬,按100 l/管分装于预冷的无菌EP管中 9.重组质粒转化克隆宿主
①将全量连接反应液12 l加入100 l TOP10competent cell,轻旋混合 ②冰浴10 min后,42℃水浴3 min,迅速放入冰水中淬2 min ③加入800l LB液体培养基,150 rpm,37℃恒温振摇1 h ④将培养液以8000rpm室温离心2 min,弃750 l 上清
⑤用管中剩余上清将沉淀重悬,涂布于含A-I-X的LB琼脂平板上 ⑥置37℃恒温培养16 h后观察
10. 克隆宿主中重组质粒的鉴定(菌落PCR法) a 菌落PCR反应体系见表3.16。
表3.16 Premix Taq (Takara)反应体系
分泌型信号肽的筛选及其在鳗弧菌分泌表达中的应用 5
物质
Premix Taq (Takara) 模板DNA(上清液) 引物M13forward 引物M13reverse ddH20 总体积
11. 重组质粒转化表达宿主 ① AV-1 competent cell的制备:
①接单菌落于5ml高盐LB中,30℃,过夜
用量 12.5 l 5 l 1 l 1 l 5.5 l 25 l
④ PCR产物进行0.7%琼脂糖凝胶电泳,鉴定转化结果。
②按1:100接二级种,50ml,30℃约3h,至O.D.600=0.4~0.6 ③收菌体,5000rmp,4℃,10min
④用272mM蔗糖洗涤3次,分别用40ml,20ml,10ml重悬菌体,5000rmp,4℃,10min
离心
⑤1ml272mM蔗糖重悬沉淀,按100l/支分装
12. 根据电泳结果从LB(A-I-X)平板上挑取对应的阳性克隆(命名为TOP10 (pUC18-gfp) TOP10(pUC18-gfpSPN)),接种于含Amp的30 ml LB培养基中,250rpm,37℃恒温振摇16h。
取适量菌体,使用Plasmid Mini Kit(修改同上)抽提重组质粒:pUC18-gfp及pUC18-gfpSPN。
13. 取10l 重组质粒转化表达宿主AV-1competent cell,方法如下:
电转杯用乙醇消毒后吹干,-20℃预冷
↓
待转质粒10l,与AV-1感受态细胞混合,加入到电转杯(2mm),场强2KV(1KV/mm),
电击3ms,之后迅速放在冰上降温
↓
电击后,质粒/细胞混合物加入1ml高盐培养基,30℃,恢复培养3h
↓
收集菌体,涂LB高盐平板(Amp200),30℃培养
从LB(Amp)平板上挑取几个单菌落并做好对应标记,进行菌落PCP鉴定,用M13引物同③。根据电泳结果从转化板上挑取对应的阳性克隆得转化子
因篇幅问题不能全部显示,请点此查看更多更全内容