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基因组断裂点识别方法及应用[发明专利]

2024-02-23 来源:好走旅游网
专利内容由知识产权出版社提供

专利名称:基因组断裂点识别方法及应用专利类型:发明专利

发明人:刘晶星,严慧,陈白雪,孙明明,赵薇薇,于世辉申请号:CN202010084468.9申请日:20200210公开号:CN111292803A公开日:20200616

摘要:本发明涉及一种基因组断裂点识别方法及应用,属于生物信息学分析技术领域。该分析识别方法包括以下步骤:数据比对:获取样本测序下机数据,将样本reads与参考基因组进行对比;构建边缘坐标集合:汇总所有reads比对到参考基因组上的起始坐标和终止坐标,所述read分割点在参考基因组比对坐标轴上的位置即为read边缘坐标;识别断裂点:筛选reads边缘坐标集中的位点,当该位点覆盖超过阈值,且该处产生了分割点的reads占总reads比例大于预设比例时,则判断为断裂点;判定断裂点:将断裂点在预设数据库中进行出现频次的查询,当出现频次小于预设频次时,则判断为高风险致病性结构变异。上述基因组断裂点识别方法,可以排除大量假阳性或者人群多态性的断裂点。

申请人:广州金域医学检验集团股份有限公司,广州市金域转化医学研究院有限公司

地址:510000 广东省广州市国际生物岛螺旋三路10号

国籍:CN

代理机构:广州新诺专利商标事务所有限公司

代理人:李海恬

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