农村开超市营业执照办理流程具体如下：
1、带上身份证、房产证、租房合同的复印件去当地工商部门先预先核准名称
2、去卫生监督部门为店主和员工办理健康证；
3、带上身份证、房产证、租房合同、健康证的复印件和名称核准通知书的复印件去当地工商部门办理食品流通许可证
4、如果卖烟，需要带上身份证、房产证、租房合同、健康证的复印件和名称核准通知书的复印件去当地烟草局申请烟草专卖零售许可证；
5、带上食品流通许可证复印件、烟草专卖零售许可证批准函、证件照、名称核准通知书原件、身份证复印件、房产证、租房合同的复印件去工商部门办理营业执照。
办理超市营业执照需要的材料如下：
1、公司法定代表人签署的公司设立登记申请书；
2、全体股东签署的公司章程；
3、法人股东资格证明或者自然人股东身份证及其复印件；
4、董事、监事和经理的任职文件及身份证复印件；
5、指定代表或委托代理人证明；
6、代理人身份证及其复印件；
7、住所使用证明。
综上所述：农村开超市营业执照办理流程带上该备齐的证件去工商部门办理。
【法律依据】：
《个体工商户登记管理办法》第二条
有经营能力的公民经工商行政管理部门登记，领取个体工商户营业执照，依法开展经营活动。
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