食品经营许可证实行一地一证的规定，在哪里办理的，到相关的部门进行查询，也就是说到所在地县级以上地方食品药品监督管理部门进行查询。
申请食品经营许可，应当向申请人所在地县级以上地方食品药品监督管理部门提交下列材料：
(一)食品经营许可申请书；
(二)营业执照或者其他主体资格证明文件复印件；
(三)与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件；
(四)其他规定的文件资料。食品卫生许可证是在当地卫生局办理的。如今的食品经营许可证也叫食品生产经营卫生许可证，是卫生许可证的一个类别之一，是国家卫生主管部门对食品生产与经营者颁发的允许进行食品生产经营的法定证件。在我国，根据《食品卫生法》的规定，食品生产经营企业和食品商贩，必须先取得卫生许可证，方可向工商行政管理部门申请登记或者变更登记。
需要申请办理食品卫生许可证的食品生产经营户，首先到县卫生局卫生监督所许可审查股领取《食品卫生许可证》申请书，并根据提供的一事一卡办事指南的要求，带齐以下资料：
1．法定代表人或负责人身份证复印件；
2．工商部门事先核准单位名称（字号）通知书；
3．房产证（或建筑许可证）或租房协议复印件等有效证明材料；
4．从业人员健康和卫生知识培训合格证明；
5．经营场所平面布局图；
6．卫生管理组织、制度。
法律依据：
《食品经营许可管理办法》
第一章总则
第一条为规范食品经营许可活动，加强食品经营监督管理，保障食品安全，根据《中华人民共和国食品安全法》《中华人民共和国行政许可法》等法律法规，制定本办法。
第二条在中华人民共和国境内，从事食品销售和餐饮服务活动，应当依法取得食品经营许可。食品经营许可的申请、受理、审查、决定及其监督检查，适用本办法。
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