公司交的医保和农村医保区别如下：
1、投保对象不同：职工医疗保险是为用人单位在职职工提供的医疗保障，农村医疗保险的参保对象主要是当地村民；
2、不同的付款人：职工医疗保险是用人单位和社会成员共同缴纳的医疗保险费。农村医疗保险由政府组织、农民自愿参加，由个人、集体和政府出资；
3、支付方式不同：医疗保险需要缴纳一定年限（一般为连续六个月），用户方可享受报销待遇。新型农村合作医疗是农民自愿参加的，每年都需要办理参保和缴费手续；
4、报销比例不同：农村乡镇卫生院新农合报销比例最高，市级以上医院报销比例相对较小。职工医保一般在定点医院就医的报销率最高，其他医院的报销率会降低。
企业医疗保险和农民医疗保险都属于社会医疗保险的范畴，由医疗保障局负责管理。我国也有一些商业医疗保险，属于商业保险公司与被保险人签订的保险合同。企业的医疗保险称为职工基本医疗保险。农民缴纳的保险，以前叫新型农村合作医疗，现在叫城乡居民医疗保险。城乡居民医疗保险是新型农村合作医疗制度与国家规定的城镇居民医疗保险的结合。这也是国家推进城乡一体化，给予农民和城镇居民医疗保险待遇的一种方式。
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》
第三十条 下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：
（一）应当从工伤保险基金中支付的；
（二）应当由第三人负担的；
（三）应当由公共卫生负担的；
（四）在境外就医的。
医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。
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