离婚协议超过两年过户是否收税要依据房产的权属以及过户的对象而定。如果是将夫妻共同财产的房屋从夫妻一方过户到另一方的，依据相关法律规定，对其不需要缴纳契税；如果不是夫妻共同财产或者是过户给第三人的，需要按照正常的房屋过户缴纳税款。
【法律依据】
根据2021年1月1日起生效的《民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
《民法典》第一千零六十二条
夫妻在婚姻关系存续期间所得的下列财产，为夫妻的共同财产，归夫妻共同所有：
（一）工资、奖金、劳务报酬；
（二）生产、经营、投资的收益；
（三）知识产权的收益；
（四）继承或者受赠的财产，但是本法第一千零六十三条第三项规定的除外；
（五）其他应当归共同所有的财产。
夫妻对共同财产，有平等的处理权。
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