建设工程合同纠纷，当事人之间不能约定管辖。根据我国法律的规定，建设工程施工合同纠纷属于专属管辖的范围，专属管辖优先适用于约定管辖。当事人约定的管辖不能违反专属管辖和级别管辖，否则约定的管辖无效。建设合同纠纷的专属管辖，由建设工程所在地的人民法院管辖。综上建设工程合同纠纷不能约定管辖。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民事诉讼法》
第三十三条 下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：
（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖；
（二）因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖；
（三）因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。
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