公司自治与《公司法》的关系如下：公司自治的依据是《公司法》；公司从事经营活动由公司自由决定，自主公司的生产经营，公司的经营活动受《公司法》的约束和调整；公司的生产经营活动有违反《公司法》的规定的，依法进行处罚。【法律依据】《中华人民共和国公司法》第五条公司从事经营活动，必须遵守法律、行政法规，遵守社会公德、商业道德，诚实守信，接受政府和社会公众的监督，承担社会责任。公司的合法权益受法律保护，不受侵犯。
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