擅自流产不构成侵犯丈夫生育权。妇女有生育自由，是否生孩子任何人不能干涉，即便妻子擅自打掉孩子，丈夫以侵犯生育权为由请求损害赔偿的，法院也不会支持。如果夫妻双方因是否生育发生纠纷，致使夫妻感情确已破裂，起诉离婚的，法院调解无效后会判决离婚。
法律依据:
《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民法典>婚姻家庭编的解释（一）》第二十三条
夫以妻擅自中止妊娠侵犯其生育权为由请求损害赔偿的，人民法院不予支持；夫妻双方因是否生育发生纠纷，致使感情确已破裂，一方请求离婚的，人民法院经调解无效，应依照民法典第一千零七十九条第三款第五项的规定处理。
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