1、计算个人所得税时，收入指的是实发工资；
2、准确地说，也就是按应发工资扣除五险一金再减去个人所得税起征点（目前仍为3500元）后的数，再适用相应税率，计算出应纳个人所得税。
计算方法
现行方法
{（总工资）-（三险一金）-（免征额）}X税率-速扣数=个人所得税。
以总工资5105元为例，五险一金105为例{5105-105-3500}X0.03-0=45元
速算扣除数是指用快捷方法计算税款时，可以扣除的数额。的计算，可以将应纳税所得额分成不同级距和相应的税率来计算。如扣除1600元后的余额在500元以内的，按5%税率计算，500－2000元之间的部分（即1500元），按10%的税率计算。如某人工资扣除1600元后的余额是1200元，则税款计算方法为：500＊5%＋700＊10%＝95元。个人所得税的计算，也可以将应纳税所得额直接按对应的税率来速算，担要扣除一个速算扣除数，否则会多计算税款。如某人工资扣除1600元后的余额是1200元，1200元对应的税率是10%，则税款速算方法为：1200＊10%-25＝95元。这里的25就是速算扣除数，因为1200元中，有500元多计算了5%的税款，需要减去。其他税率所对应的速算扣除数分别是：15%：125，20%：375，25%：1375，30%：3375，35%：6375，40%：10375，45%：15375。
按现在的《个人所得税法》，工资每月发和年终一起发税额是一样的，只是每月发可能会造成税额不均衡，当月工资多个税就高，当月工资少可能没有个税，但最终总的税额是一样的。
若出现平时多缴税，而全年拉通不需缴税或应少缴税的情况，可予次年汇算时申请退税。
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