没有什么影响，个人所得税的退税处理是国家的相关政策规定，公民可以依据政策规定的要求来办理退税处理，不存在造成不利的影响的情况，涉及到相关事项的处理上，还需要按照上述规定的程序来进行操作，如果存在错误的可能导致无法位办理退税。个税(综合所得：包含工资薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费)是通过个人应付工资扣减社保等支出、国家法定扣除、其他附加扣除后计算的数。个税退税是因为现在综合所得方面采取的是平时预缴，年度汇缴的方式，在计算退税时一般不会影响缴纳社保所依据的基数。
二、个人所得税退税的操作流程是怎么规定的？
第一步：准备申报
安装个人所得税软件，打开软件后，先进行注册登录，进入年度汇算：首页【常用业务】—【综合所得年度汇算】；
1)进入申报界面后，填报方式有【使用已申报数据填写】和【自行填写】两种选择。
2)为了方便申报，推荐大家选择【使用已申报数据填写】，税务机关已按一定规则预填了部分申报数据，大家只需确认即可。
3)选择【使用已申报数据填写】—【开始申报】后，系统提示【标准申报须知(使用已申报数据)】，点击“我已阅读并知晓”，开始年度汇算申报。
第二步：确认信息
需要对个人基础信息、汇缴地、已缴税额进行确认
第三步：填报数据
确认预填的收入和扣除信息无误，可直接点击【下一步】。
第四步：计算税款
数据系统将自动计算您本年度综合所得应补(退)税额
第五步：提交申报
确认结果后，点击【提交申报】即可。
第六步：退(补)税
如存在多预缴税款，可选择【申请退税】。
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