合作医疗电子凭证激活流程：
1、先在自己的手机上下载“国家医保服务平台”这个app；
2、下载好APP后点击最下方的“医保电子凭证”进入相关界面；
3、如果是为激活的话，点击右上角的“立即注册”；
4、之后在输入参保人身份信息并进行人脸识别就可以了；
5、最后选择参保地，点击“立即激活”即可。
合作医疗查询方法如下：
1、电话查询，拨打人力资源社会保障咨询服务电话12333，根据语音提示进行查询，也可以转接人工服务查询；
2、窗口查询，携带本人有效证件及社保卡号，到当地新农合机构查询。有些农村的费用是统一交给村镇的相关办事处然后再一起缴费，也可以去这些办事点查询；
3、第三方查询，很多城市的新农合可以通过微信进行缴费，同时也可以查到缴费记录。
【法律依据】
《中华人民共和国社会保险法》
第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。第七十四条 社会保险经办机构通过业务经办、统计、调查获取社会保险工作所需的数据，有关单位和个人应当及时、如实提供。
社会保险经办机构应当及时为用人单位建立档案，完整、准确地记录参加社会保险的人员、缴费等社会保险数据，妥善保管登记、申报的原始凭证和支付结算的会计凭证。
社会保险经办机构应当及时、完整、准确地记录参加社会保险的个人缴费和用人单位为其缴费，以及享受社会保险待遇等个人权益记录，定期将个人权益记录单免费寄送本人。
用人单位和个人可以免费向社会保险经办机构查询、核对其缴费和享受社会保险待遇记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
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