医药文献检索与利用（zll）
一、检索总论
1。1 信息及信息素养
信息：是普遍存在的，是物质的一种基本属性，是物质存在方式及其运动规律、特点的外在表现。
信息定义：事物的运动状态和状态变化的方式。
信息与知识的区别:信息是大家的，独立于行为和决策，独立于环境存在，容易转让，可复制。
情报:传递有特定效用的知识（知识性,传递性，效用性)。
文献：以文字、图形、符号、声频、视频等手段记录和传播知识的载体.
（知识内容、信息符号、载体材料、记录方式）
文献按加工层次划分：
一次文献（原始论文-—期刊论文、学位论文、研究报告、专利说明书）；
二次文献(目录、索引、文摘,pubmed、web of science、sinomed）；
三次文献（综述、年度总结、年鉴、指南、百科全书、annual reviews)；
零次文献(未被正式发表的,书信、手稿、笔记、口头交流）
文献按载体形式划分：印刷型、电子数字型、缩微型、声像/视听型
文献按出版类型划分:图书(ISBN号 10位，4段-—地域号、出版社号、书号、校验号；本馆订购的电子图书:apabi,超星、读秀、elsevier、karger、Springer）、期刊(ISSN号 8位，前七位是刊名代号，末位是计算机校验号）、特种文献
整个信息行为：信息需要、信息检索、信息选择、信息利用
信息素养定义：人们在工作中运用信息、学习信息技术、利用信息解决问题的能力。
信息素养的构成要素：信息意识；信息能力；信息道德.
ACRL信息素养能力的评价标准：（5个一级指标，24个二级指标）。
1。2医学文献检索相关概念
指从文献信息集合中查找所需文献或文献中包含的信息内容的过程
1.3计算机检索原理概述
检索提问字符串 匹 配 数据库中特征标识字符串
数据库的构成:文档、记录、字段
常见字段：TI（题目) 、AB（文摘）、AU(作者)、MESH（主题词)、 SO(期刊名称)、 AD（作者单位)、DT（文献类型)、PY（出版年)
1。4检索语言
文献外部特征的检索语言：题名、著者、文献序号、引用序号
文献内容特征的检索语言:分类检索、主题检索、代码检索
（1)分类检索:美国国立图书馆图书分类法，杜威十进制、国际十进制、中国图书馆分类、国际疾病分类。
(2）主题检索：是以规范化的词汇来表达文献内容的主题；主题词(叙词）、副主题词（限定词）、关键词。
(3）代码检索：化合物分子式索引等
1。5计算机检策略与步骤
（1）布尔逻辑检索：NOT 〉AND〉 OR，括号优先
（2)截词检索：？代表一个字母,必须以半角状态输入 ％或＊代替任意个字符
(3）位置运算检索：（W)、（nW）、（N）、（nN）、（F）、（S）、(L)
（4）字段限定检索:“=”或 “in”
（5）计算机检索的一般步骤：(大题)
分析检索课题（课题所属的学科范围、要求的文献类型、年限、语种、需要的文献量等)
选择检索工具（数据库的选择)
确定检索途径（首先选择基本检索方式全字段检索）
根据检索结果调整检索策略（考虑关键词的重述与转换，拆分）
根据文献线索，获取全文
（6）检索结果的评价（收录范围、查全率、查准率、相应时间、用户负担、输出形式）
查全率：R=检索出的相关信息量/信息系统中的相关信息总量
用or组配，用上位词（扩展下位词)，用截词，少用副主题词匹配
查准率： P=检索出的相关信息量/检索出的信息总量
1。6 本馆电子资源介绍
（1)中文
sinomed ：二次文献库
CNKI、万方、VIP：期刊全文数据库
超星、先生之家：电子图书
读秀、发现:一站式资源整合平台
（2)外文
pubmed和web of science：：二次文献库
二、常用的中文数据库
2。1 SinoMed
本馆订购：中国生物医学文献数据库(CBM)(1978年以来《医学主题词表》；《中医药学主题词表》；《中国图书馆分类法·医学专业分类表》）、中国医学科普文献数据库(2000年以来）、北京协和医学院博硕学问论文库（1981年以来）。
数据库特点：
(1）检索入口多,检索策略制定灵活
多种检索途径:快速检索、高级检索、主题检索、期刊检索、作者检索
多种限定条件:年代、文献类型、年龄组、性别、对象类型、其它
（2）词表辅助检索功能
主题导航
（3）多角度的文献分析功能（可以,txt，excle格式导出）
(4)定题检索(定期的跟踪某一个课题的最新的文献)
我的空间—〉我的检索策略
可以将检索策略保存到我的空间，保存的检索策略可以定期的发送到邮箱或RSS订阅
（5）能获取详细的书目信息及全文链接
检索方法与技巧：(夸库检索仅支持标黄的）
（1）快速检索：在文章标题、摘要、作者、关键词、主题词等字段检索，检索出之间
可以用逻辑运算符not，and,or链接，默认为and
（2)高级检索：可以限定在某一特定字段检索，智能检索（自动转化为主题词）,精确检索（关键词、主题词、特征词、分类号、作者、刊名、ISSN），限定检索,灵活组配检索式。
(3）限定检索：常用限定条件如年代、文献类型、研究对象等加以整合，可使已检出的文献数量有针对的减少，避免二次检检索操作。限定内容可以多选，同组内的限定为“or\"关系，不同组之间的限定为“and\"关系，限定完成后可以在检索前设定，也可以在检索后设定。
（4）主题检索：用规范化的主题词进行检索,有利于提高查全率和查准率
主题词“加权\"表示主题词的重要程度，反映文章论述的主要内容.加权主题词用“＊”表示.
主题词扩展检索是指对当前主题词及其下位主题词进行检索，系统默认状态为扩展检索
可以使用主题导航
（5）分类检索
类名,类号
可以使用分类导航
（6）期刊检索
根据刊名、出版地、出版单位、及期刊主题词、ISSN相关信息进行检索
可以使用期刊分类导航和首字母导航进行检索
(7）作者检索
比较有效地解决“同名著者\“同构异名\"的问题
(8)定题检索
可定制和跟踪某一课题的最新文献.首次使用该项功能则需要注册，注册是免费的。
（9)引文检索
检索结果的处理：
显示：题录格式、文摘格式、详细格式
输出：单次打印和保存（最大记录数500），单次e—mail(最大记录数50）
2。2 CNKI（最早可以追溯到1915年）
资源范围:中国学术文献总库（学术期刊、博士论文、优秀硕士论文、工具书、会议论文、年鉴、报纸、专利、标准等)、我馆已购买的数据库及专辑
检索方法：跨库检索、单库检索（默认为跨库检索,可以选择单库检索）
(1）跨库检索：一次性在所有类型资源中检索，但检索入口少
（2）单库检索:选择在某一特定数据类型库中检索，检索入口多
支持的检索方法
（1)基本检索:
检索字段(主题、 篇名、关键词、作者、单位、基金、参考文献、 中图分类）多角度分组浏览（学科、发表年度、基金、研究层次、作者、机构）
多角度检索结果排序（主题、发表时间、被引、下载)
（2)高级检索
多个检索入口组配
多种限定条件（年限、来源期刊、来源类别支持基金、作者及单位)
（3)专业检索(需要自己设计检索式）
（4)作者检索
(5)来源期刊检索
（6）句子检索（全文检索+位置检索)
句子中包含了大量的事实信息，可以为用户提供相关事实问题的答案。
知网节（文献网络图）：
是中国知网特有的技术概念，清晰地反映文献的继承与发展。
共引文献：与本文有相同参考文献的文献。
同被引文献：与本文同时作为参考文献的文献。
引证文献:引用本文的文献。
二级引证文献：本文参考文献的参考文献.
2.3万方数据库 1998年
独家收录中华医学会杂志
跨库检索：
（1）可以对检索结果按相关度、时间、被引次数、经典论文等角度显示。
(2）支持检索结果以标准参考文献格式或参考文献管理软件格式导出。
（3)可以对检索结果从学科分类、论文类型、年份、发表期刊等角度分析。
高级检索：
经典高级检索:
专业检索：可以根据系统提示字段输入检索出的逻辑运算符
知识网络分析:从时间维度揭示知识点的关注度，了解学科发展规律，有助于发现新的研究方向、研究趋势和热点研究。
2。4维普资讯 1989年
基本服务:期刊文献检索、文献引证追踪、科学指标分析、搜索引擎服务
基本检索：
传统检索：专辑导航、分类导航
高级检索：实现同义词索引功能防止漏检;同名作者功能缩小检索范围
检索执行从上到下的顺序,而不是逻辑优先顺序
期刊导航:可通过期刊导航实现期刊逐期浏览,也可以定制自己关注的 期刊
检索历史：
2.5三大全文数据库的比较
从收录资源角度:知网最全；万方没有收录报纸、工具、学习；维普只有全文、报纸、学习和外文
从检索方式角度:
（1)中国知网单库检索方式比万方数据多，其中： 科研基金检索、句子检索、文献出版来源是其特有的检索方式。
（2）万方数据学术期刊检索特有字段为: 被引用次数、DOI数字对象唯一标识符 、有无全文。
（3）维普资讯的特有检索字段：栏目信息
（4）单库检索字段而言，中国知网、维普的检索字段多于万方数据
从收录学位论文角度：
(1）知网对硕士论文单位的收录数量较多
（2)万方数据库收录了部分单位的博士后论文
（3）维普没有收录学位论文
2.6 读秀学术搜索-—以海量中文资源为基础的知识库，整合了多种资源，通过统一检
索平台,实现一站式检索。
三、常用的外文数据库
3。1 Pubmed
Pubmed简介:NCBI建立了生物医学文献数据库,使用的是Entrez检索平台，每周更新。约5％的文献提供免费全文,前身是medline光盘数据库.pubmed由medline(1946年以来，均进行过主题词标引)、premedline(临时性医学数据库）、 publisher supplied citation（出版商递送的电子文献)和old medline构造.
Entrez平台:是资源整合系统，可检索NCBI提供的30多个数据库。
截词检索:截词符*,只有右截词，会自动关闭自动匹配与转换功能。
词汇自动转换：系统会自动将检索词语转换为相应的mesh词和textword词。
精确检索:在短语上加半角双引号“\"后,系统将不再进行自动转化，而进行精确检索。
基本检索:
可以输入任何字词，系统会自动识别并匹配进行检索；
可以输入逻辑表达式；
可以进行字段限制检索。
高级检索:
检索表达式生成器--提供字段进行字段限制检索,逻辑组配检索，根据检索需要,进行逻辑组配,生成复杂的检索表达式
检索历史-—显示检索过程，可以进行逻辑组配，可对检索历史进行保存和删除。
主题词检索：
有很好的准确性与专指性,在新文献及新概念上存在缺失和时滞
期刊检索：可以查看期刊的相关信息,也可以检索该刊上发表的文章。
检索结果过滤：
文本过滤、出版时间过滤、实验对象过滤、文献类型过滤、语种过滤等。过滤的设置对后续检索均有限制作用，可以通过clear all链接清除重新设置
单篇引文匹配器 single citation matcher：用于单篇文章的查找
临床咨询 clinical queries：专门为临床医生设计
检索结果处理:
（1)检索结果显示
(2）课题追踪
（3）检索结果保存(send to）
File：将全部检索结果或选择数据保存到本地电脑中
Clipboard：其暂时保存作用,最多保存500条记录。从剪贴板中可进行保存到本地电脑、发送到邮箱等操作。
Collections：将文献添加到个人文献集中，需要登录my ncbi.
E_mail:将文献发送到个人邮箱,不需要登录my ncbi
Order:向NLM订购全文
My Bibliography：需要登录my ncbi，将检索结果添加到我的书目数据库中。
（4)my nibi个性化服务
3.2 Web Of Science
简介:web of science是大型综合性、多学科、核心期刊引文索引数据库,web of science核心集合是其中的引文索引数据库(包括了SCI、SSCI、A＆HCI）。
引文检索：是指对文章的参考文献进行的检索,是从学术论文中引证关系入手进行检索的一种方法。（意义：揭示科学研究的过去、现在、将来的之间内在联系，揭示科学研究中
所涉及的各个学科领域的交叉联系，协助研究人员迅速地掌握科学研究的历史、发展和动态。）
检索规则：
逻辑运算符：not、and、or
位置运算符：same、near/n（n默认是15，)
截词符：?表示单个字符、*表示多个字符
精确检索：“”
期刊引证报告journal citation reports (JCR):
是对引用和被引用数据的统计,数据每年更新。
JCR作用：
确定投稿期刊是否被SCI收录,期刊的变更信息等。
了解期刊的详细信息，包括影响因子及其变化趋势、出版国家与出版商等。
对期刊进行多角度的比较。
按照学科、影响影子、期刊分区等方式选择合适的投稿期刊.
IF（期刊影响因子）：
是国际上通用的评价期刊影响力的一个重要指标。一般来说影响因子高，期刊的影响力就越大。对于一些综合类,或者大项的研究领域来说，因为研究的领域广所以引用率也比较高。
通过描述文章内容的关键词选择合适的期刊投稿:
在WOS核心合集中检索相关文献;通过来源出版物的分析功能， 寻求合适的投稿期刊
或分析功能可以找到某些内容比较集中的期刊
四、外文全文数据库
定义:外文全文数据库是指提供了一次文献的外文数据库
分类：
（1）出版商提供的网络电子平台，一般只提供自己出版的文献，Elsevier的 SD，Springer,Karger.。。。
（2）数据库代理商，整合多家资源，Ebscohost，OVID。.。。
（3）open access 开放获取期刊
本馆订阅的外文全文数据库:
(1)图书期刊类:annual reviews,acs，ebscohost，karger,ovid,springer, pnas，nature，scinece, sciencedirect
（2)特征文献：pqdd
（3）循证医学库：cochrane library
具体介绍：
science direct：
（1）简介:由世界上最大的学术期刊出版商elsevier开发的，全球最著名的的科技医学全文数据库之一,我馆目前可访问1997年以来的2000多种电子期刊。
（2）检索规则：
位置算符: W/n (词的顺序任意)
Pre/n(两个词之间的顺应是固定的）
截词符： ？ *
宽松短语检索：“ ”（标点符号、连字符、停用字等会自动忽略）
精确短语检索： ｛｝
(3)四个模块:
physical science and engineering（自然科学）
life sciences（生命科学)
health sciences （健康科学)
social science and humanities(社会科学）
(4）检索方法：
基本检索:
高级检索：
(5）检索结果的处理：
检索结果个进一步限定（refine filters）
检索结果的保存，全文的下载
订阅检索结果或期刊内容(save search alert)
Clinicalkey：
基于爱思唯尔全部的医学内容开发的，权威而全面。包括期刊、参考书、视频、图片、影像、临床试验、诊疗指南、药品专论等等。
Wiley online library：
(1）简介:1807年创立于美国，出版学术期刊、过刊集、图书、参考工具书、实验室指南、循证医学图书馆等
（2）检索途径：
期刊浏览方式（字序、学科)
基本检索
高级检索
（3）Lab protocals
Cochrane Library(Wiley） 循证临床证据数据库:
Cochrane协作网是1993年正式成立的国际性协作组织，其目的是对临床医学各个领域所开展的随机对照试验进行全面、系统、定量的综合分析和评价，以电子出版物的形式发表结果，为临床医疗、科研及医疗卫生决策提供可靠的科学依据。
OVID数据库：
Annual Reviews:
是一家致力于向全球科学家提供高度概括、实用信息的非赢利性组织，专注于出版权威综述期刊；AR邀请各学科领域最权威、顶尖的科学家撰写综述,回顾本学科最前沿的进展，为科学研究提供方向性指导
springer:(德国)
PQDD：
是目前国内唯一的可以查询国外大学(北美地区为主)优秀博硕士论文全文的数据库，数据库覆盖了大部分北美地区高等院校以及世界其他地区数千个高等院校每年获得通过的博硕士论文。
五、文献管理软件
文献管理软件是适应科技文献的快速增长开发的工具，集参考文献的检索、收集、整理功能于一体,帮助用户高效管理和快速生成参考文献。这类软件提供的附件、笔记、查找、分析等功能,可以帮助用户实现包括文献检索、文献阅读、文献引用的全过程管理。
常用的文献管理软件：
NoteExpress 、EndNote、Biblioscape 、Reference Manager、ProCite 、RefWorks
具体介绍：
NoteExpress
是目前流行的参考文献管理工具软件之一，其核心功能是帮助读者在整个科研流程中高效利用电子资源，检索并管理得到的文献摘要、全文；在撰写学术论文、学位论文、专著或报告时,可在正文中的指定位置方便地添加文中注释，然后按照不同的期刊,学位论文格式要求自动生成参考文献索引。
其核心功能包括：检索、管理、分析、发现和写作。
EndNote
是一个专门用于科技文章中管理参考文献数据库的软件，是SCI(Thomson Scientific 公司)的官方软件,支持国际期刊的参考文献格式有三千多种，写作模板几百种,涵盖各个领域的杂志。
TS= 主题
TI= 标题
AU= 作者 [索引］
AI= 作者识别号
GP= 团体作者 ［索引]
ED= 编者
DO= DOI
SO=出版物名称 ［索引]
IS=ISSN号［索引]
PY= 出版年
AD= 地址
OO= 机构
OG= 机构扩展 ［索引］
CU= 国家/地区
FO= 基金资助机构
FG= 授权号
FT= 基金资助信息
SU= 研究方向
WC= Web of Science 分类
IS= ISSN/ISBN
UT= 入藏号
分析检索课题：课题主题分析，主要概念有：视盘脉管炎、中医药治疗或中医药疗法。学科范围属于自然科学的医学领域.用户是希望了解中文医学期刊发表此方面的文献情况，并希望发表相关方面的论文，所以文献信息检索的对象主要是期刊论文。检索要求，应该是查全查准。
数据库选择：鉴于中文医学期刊的文献调研需求,sinomed、cnki、万方和维普平台符合检索要求。
确定检索途径：
（1）sinomed
默认检索方式一框式全字段检索:视盘脉管炎and 中医药治疗
考虑关键词的重述与转换：在sinomed主题词表检索入口输入“视盘脉管炎”没有对应的词汇，说明没有这样表达形式的主题词,输入“视盘”显示为主题词，对应的款目词有“视神经乳头”“脉管炎”对应的主题词“血管炎”，考虑副主题词。“视盘”[不加权：扩展]and“血管炎/按摩疗法/气功疗法/中医病机/中药疗法/中医疗法”［不加权：扩展］。
评价检索结果,修正检索策略：结合sinomed主题词标引的实际情况，一框式全字段检索，再次编写检索表达式（视盘 or 视神经头 or 视神经乳头） and（脉管炎 or 血管炎）and （中医 or 中药 or 中成药 or 中西医 or 中草药 or 辨证）
分析检索课题:课题主题分析,主要概念有：B超(B Type ultrasound)、钼靶x射线摄影术（mo-target-x—ray radiography）、乳腺疾病诊断（breast diseases diagnosing）；次要概念对照分析(contrast evaluation )。学科范围属于自然科学的医学领域；用户是希望了解国外医学期刊发表此方面的文献情况，并发表相关文献的论文，所以文献信息检索的对象主要是期刊论文。检索的要求，应该是追求查全和查准.
数据库的选择,鉴于国外医学期刊的文献调研需求,pubmed数据库符合要求。
确定检索途径:
首先选择pubmed基本检索方式全字段查找.根据现有的信息编写主要的概念检索式 B Type ultrasound and mo—target-x-ray radiography and breast diseases diagnosing and breast diseases diagnosing 试检，结果为0篇。
此情况需要考虑关键词的重述和转换。可以借助pubmed主题词表的树状结构表来实现关键词的重述与转换。在pubmed主题词表输入B Type ultrasound没有对应的词汇出现说明没有这样的形式的主题词，可以采用概念归纳和概念划分的方法来确定主题词。选择上位词ultrasound,词表相关首位词为ultrasonography 阅读定义符合上位概念，点击该词进入树状结构表，其下位词ultrasonography mammary 最符合该课题检索用词。在主题词表输入mo-target—x—ray radiography没有对应的词汇出现说明没有这样的形式的主题词，可以采用概念归纳和概念划分的方法来确定主题词。选择上位词radiography点击该词进入树状结构表,其下位词mammography 最符合该课题检索用词。
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