所谓的零申报的企业，就是没有应税收入，也没有应纳税额，当然如果零申报企业注销的，那么也需要按照一般公司一样办理注销程序。一、公司零申报如何注销零申报企业跟一般公司的注销流程一样。注销流程如下：1、成立清算组。2、展开清算工作。清算组自成立之日起接管公司，开展以下业务：接管公司财产、了结公司未了业务、收取债权、清理债务、分配剩馀财产、注销公司法人资格并吊销营业执照。3、通知债权人申报债权。4、提出清算方案。清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，拟定提出清算方案，报股东会讨论通过或者主管机关确认。清算方案的主要内容有：清算费用、应支付的职工工资和劳动保险费、应缴纳的税款、清偿公司债务、分配剩馀财产、终结清算工作。在清算进行完以后，才能进行注销。二、公司注销登记公司注销过程需要分别去以下7个部门或机构办理相应账户注销：1、社保局：核查是否有未缴清社保费用，然后注销公司社保账号。2、税务局：核查是否有未缴清税款或费用，然后注销公司的国、地税。3、报纸媒体：公司需自行登报公示，宣告公司即将注销。4、工商局：办理公司注销备案，注销营业执照。5、开户行：注销公司开户许可证和银行基本户等其他账户。6、质监局：到质监局注销公司的许可证例如生产许可证。7、公安机关：注销公司印章的法律效应（印章本身可不上交）。三、公司注销材料申请注销前公司应开展公司清算，公司清算完成后便可进入公司注销申请程序，清算后、注销前公司需要出具和准备如下报告：1、公司清算组负责人或公司法定代表人签署的《公司注销登记申请书》；2、清算组成员《备案确认申请书》；3、法院破产裁定、行政机关责令关闭的文件或公司依照《公司法》作出的决议；有限责任公司提交股东会决议，股份有限公司提交股东大会决议。有限责任公司由代表三分之二以上表决权的股东签署，股东为自然人的由本人签字，自然人以外的股东加盖公章；股份有限公司由代表三分之二以上表决权的发起人加盖公章或者股东大会会议主持人及出席会议的董事签字确认。国有独资有限责任公司提交出资人或出资人授权部门的文件。因违反《公司登记管理条例》有关规定被公司登记机关依法撤销公司设立登记的，提交公司登记机关撤销公司设立登记的决定。4、股东会或者有关机关确认的清算报告；’5、刊登注销公告的报纸报样；6、法律、行政法规规定应当提交的其他文件；国有独资公司还应当提交国有资产监督管理机构的决定，其中，国务院确定的重要的国有独资公司，还应当提交本级人民政府的批准文件。根据法律规定可以得知，零申报企业跟一般公司的注销流程一样。需要先成立清算组，在清算进行完以后，才能进行注销。