法律分析:
1.社保中的医保，主要用于看病报销，包括住院医疗费用报销生育补助以及普通门诊等统筹医疗费用的报销。而新农合用于的地区不同报销比例也是不同的。
2.如果在乡镇医院治疗的话，新农合的报销比例较高;如果在市级医院以上的医院的话，社保的报销比例较高。
3.两者都是随着医院级别的升高而报销比例降低。如：社保的医保报销比例一般为70%-85%，新农合约为50%-70%。
法律依据:
《中华人民共和国城镇职工基本医疗保险条例》
第一条 为保障城镇从业人员的基本医疗，合理利用医疗资源，根据国家的有关规定，结合本省实际，制定本条例。
第四条 基本医疗保险费由用人单位和从业人员双方共同负担。
第五条 基本医疗保险原则上以市、县、自治县为统筹单位，实行属地化管理。
第六条 基本医疗保险费由本省地方税务机关（以下简称征收机关）征缴。