对于治疗灰指甲的方式，其实目前是有很多种的，包括许多的偏方，其实也是很有效的。想要完全的治愈灰指甲，患者需要坚持的进行治疗和用药，因为这属于真菌感染的疾病，如果没有彻底治愈的情况下中断了用药或者治疗，就会引起灰指甲的再度复发。
1、封包削法。将汉肤特康软膏涂于患甲上封包起来，待软化后削治。对已被真菌侵犯的变形、增厚的甲板予以削法，即去除增厚的、松脆的、凹凸不平的或有灰白色斑点的甲板，以得抗真菌药物直接发挥作用。此法一般无出血，不易感染，也很少引起疾病，无副作用，在短期内可将残存在甲床上的甲屑削治干净，这也是一种灰指甲的治疗方法。
2、口服药物。这是最简单的灰指甲的治疗。单纯服用抗真菌药物，如灰黄霉素、伊曲康唑、特比萘芬(兰霉舒)、氟康唑等，有显著疗效，且方便。但口服这类芗必须达到真菌所寄生的病甲处，才能发挥抗菌作用，因此，用药时间较长，指甲癣需服用3个月，趾甲癣需6个月左右。口服药物进行灰指甲的治疗均有副作用，儿童慎用，孕妇、肝功能异常者禁用。
3、剥脱法。可与局部和系统疗法联合应用，分为化学法和外科法，前者主要应用尿素软膏，也有人应用二氧化碳激光治疗，烧灼剥脱甲板，在甲床愈合后，外用抗真菌剂。或者在甲板上打多个触及角化过度组织的洞，再涂以外用药。