宝宝早上起床咳嗽可能是正常的咳嗽反射
家长会发现宝宝早上起床时会有几声咳嗽，这是由于经过一个晚上，在呼吸道可能会积聚了一些分泌物，当呼吸道存在某些异物（包括炎症分泌物）时，局部（如咽喉部）会有不舒服的感觉，或者说有要咳嗽的感觉，这时通过正常的咳嗽反射可将这些分泌物排到咽部，然后可以将这些异物咳出体外。
因此，咳嗽对人体也是一种保护作用的反射性功能，当然，如果这种现象若长期存在，也要注意有无呼吸道慢性炎症使分泌物增多而引起咳嗽反射。
宝宝早上起床咳嗽可能是过敏性咳嗽
过敏性咳嗽又称咳嗽变异性哮喘，是哮喘的一种特殊表现，主要为咳嗽持续或反复发作超过一个月，常伴夜间或清晨发作性咳嗽，痰少，运动后加重，临床无感染表现。或经较长时间抗生素治疗无效，用支气管扩张剂治疗可使咳嗽发作缓解，往往有个人或家族过敏症。咳嗽多在夜间或凌晨，呈阵发性，无气喘及发热，胸部X线摄片及血液检查均无明显异常。
建议积极查找过敏原，如果自己查不清，可到有条件的医院进行过敏原测验，一旦明确病因，立即脱过敏原，并进行脱敏治疗。若使用药物，那么药物的使用和停药，一定要在医生的指导下进行，否则擅自改变治疗方法或治疗不彻底都有可能留下病根。
宝宝早上起床咳嗽可能是肺热
中医认为，早晨咳嗽可能是肺热引起的，这说明宝宝体内有火。家长平时一定要让孩子多喝水，可以煲一些冰糖雪梨粥让宝宝喝，另外多吃水果蔬菜，少吃甜食，以及油腻的食物。也可以给宝宝推推后脊柱，由下到上，每天坚持五分钟。必要时可适当给点清肺热的药物，如金振口服液、小儿葵花肺热咳喘口服液进行治疗。
宝宝早上起床咳嗽可能是慢性咽炎
宝宝若早上经常咳嗽干呕的话，考虑是有慢性咽炎的，宝宝营养不良、经常接触高温、粉尘、有害刺激气体容易引起慢性咽炎的发生。患咽喉炎的宝宝多有声音嘶哑这一症状，家长要密切关注，应给宝宝对症治疗，通畅大便，多喝白开水，也可以给宝宝喝一些咽炎颗粒。
宝宝早上起床咳嗽可能是急性上呼吸道感染
宝宝急性上呼吸道感染也会导致早上咳嗽，小儿急性上呼吸道感染各种病毒和细菌均可引起，但以病毒为多见，约占90％以上，主要有鼻病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒、副流感病毒、腺病毒、柯萨奇病毒等。也可继发细菌感染，最常见的为溶血性链球菌，其次为肺炎球菌、流感嗜血杆菌等肺炎支原体亦可。
急性上呼吸道感染作为小儿最常见的疾病，主要治疗措施是护理、对症处理和抗病毒治疗，绝大多数患者无需使用抗生素和激素。对于早期患儿可以适当给予抗病毒治疗，具体要看患儿病情。
宝宝早上起床咳嗽可能是急性支气管炎
宝宝急性支气管炎同样也会导致早上咳嗽，急性支气管炎主要为感染，病原为病毒、肺炎支原体或细菌，或为其混合感染，能引起上呼吸道感染的病原体都可引起支气管炎。这种病2岁以下的婴幼儿多见，起病多数较急，发病前数日多先有上呼吸道感染，主要临床表现为发热、咳嗽、气促、肺部固定性的中、细湿啰音。
由于病原体多为病毒，一般不采用抗生素，建议宝宝多休息，保持良好的周围环境，经常变换体位，多饮水和补充大量维生素C等。